本实验室依托复旦大学，于1994年2月成立，初名为“国家教委聚合物分子工程开放实验室”，1999年9月改为第一批教育部重点实验室，更名为“聚合物分子工程教育部重点实验室”。实验室至今经历过三次（1998、2003、2008年）教育部评估，连续获得优秀，并相继三次（1999、2004、2009年）在科技部化学领域国家重点实验室和少量优秀部门重点实验室联合评估中皆获良好。 实验室的主体依托学科是高分子化学与物理全国重点学科（高分子科学系）。